Debemos añadirlo a nuestro xml dentro de layout llamado cms.xml
app\design\frontend\default\template\layout\cms.xml
En la zona donde especifica CMS Home Page incluiremos nuestros reference donde tendremos la opcion action con el js en cuestion.
<cms_index_index translate=»label»>
<label>CMS Home Page</label>
<reference name=»head»>
<action method=»addItem»>
<type>skin_js</type><script>nivo/scriptaculous.js</script>
</action>
<action method=»addItem»>
<type>skin_js</type><script>nivo/protoshow.js</script>
</action>
<action method=»addItem»>
<type>skin_js</type><script>nivo/site.js</script>
</action>
</reference>
</cms_index_index>
<cms_index_index translate=»label»>