Pues nos ha tocado arreglar una migración de una aplicación con unas cuantas librerias por duplicado, pero en fin parece ser que su aplicacion de generar pdf consume bastante y nos arroga en parte web nos muestra
internal server error 500 y en el log el mensaje es claro
mod_fcgid: read data timeout in 45 seconds
Asi que investigando este modulo de apache debemos tocar los parametros dentro del conf de nuestro virtualhost
Este seria el original y este el que yo deje y funcional
<IfModule mod_fcgid.c>
FcgidInitialEnv PP_CUSTOM_PHP_INI /var/www/vhosts/dominio.es/etc/php.ini
FcgidMaxRequestLen 1073741824
ProcessLifeTime 7200
IPCCommTimeout 7200
IPCConnectTimeout 300
</IfModule>
Ahora nos toca reiniciar apache y listo.